Родился в Москве в 1966 году. В 1988 году закончил химический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова.
В 1990-е годы занимался филологической работой: писал монографию о поэтике Иосифа Бродского, изучал творчество Томаса Пинчона, переводил Стивена Кинга и Сьюзен Зонтаг, публиковался в толстых журналах. С 1996 года писал о кино и литературе для многочисленных бумажных и сетевых СМИ. В 2001 году был награждён Knight Fellowship Стэнфордского университета и провёл год в Калифорнии. После возвращения в Россию в 2002 году сочетал писательскую, предпринимательскую и журналистскую деятельность. Публиковался в газетах «Ведомости», «Сегодня», «КоммерсантЪ», «Русский телеграф», журналах «Птюч», «ОМ», «Premiere», «Harper’s Bazaar», «Vogue», «Сеанс» и других.
Член Союза кинематографистов России и ПЕН-клуба.
Книга «Живые и взрослые» получила премию «Итоги 2011» журнала «Мир фантастики» в номинации «Мистика и хоррор». Роман «Калейдоскоп. Расходные материалы» вошёл в длинные списки различных литературных премий («Национальный бестселлер», «Русский Букер», «Большая Книга», «Ясная поляна»), а также в короткие списки премий «Студенческий Букер-2016», НОС и «Новые горизонты». Книги Сергея Кузнецова переведены на иностранные языки.